Համալսարանի կառավարումն իրականացվում է Հայաստանի Հանրապետության օրենսդրությանը և Համալսարանի կանոնադրությանը համապատասխան, ինքնակառավարման հիման վրա` միանձնյա ղեկավարման և կոլեգիալության սկզբունքների զուգակցմամբ, ինչպես նաև կարևորագույն հարցերի լուծմանը Համալսարանի կոլեկտիվի մասնակցության սկզբունքների վրա:
Համալսարանի կառավարման մարմիններն են.
• Հիմնադիրների խորհուրդ • Գիտական խորհուրդ • Ռեկտոր • Ուսխորհուրդ
